植物学为生物学一级学科的二级学科，本学科于1981年被批准为硕士学位授予点，是西南林业大学较早拥有硕士学位授予权的学科之一。

  本学科具有深厚的科研传统，稳定的学术方向。长期以来致力于西南地区植物区系及植物多样性的调查，对一些重要类群进行了深入的系统学和分类学研究。经过几代人的共同努力，植物标本室已成为全国高等院校中收藏种类最多、收藏量最大的植物标本室之一。收藏量近20万份，形成以收藏西南地区树木标本、壳斗科标本和竹类标本为主 要特色，是全国壳斗科植物和竹亚科植物收藏种数最多、最全、且数量最大的标本室之一。

  在植物学基础研究的有力支持下，整合学校师资力量建立了竹藤科学研究院、国家林业和草原局丛生竹工程技术研究中心，同时依托西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室、西南地区生物多样性保育国家林业和草原局重点实验室等平台， 开展珍稀濒危植物保护遗传学和谱系地理学、植物种质资源利用、植物系统分类学、植物区系地理、高山植物多样性及高寒植被生态学等研究，逐步形成了植物资源分类、培育与利用、植物多样性保护与利用、自然保护区本底调研等方面的研究优势和特色。