生理学是属生物学一级学科的分支学科，本学科于2011年被批准为硕士学位授予点， 是以生物机体的生命活动现象和机体各个组成部分的功能为研究对象的一门科学。主要研究方向包括树木生理学、抗性生理学等方向。由于西南林业大学地处我国西南地区的云南省，气候与物种丰富多样性造就了生命活动机理的多样性。因此该学科更具有显著地地域特色。生物体的生命活动十分复杂，并且不同类型的生物体具有不同的生理特征，但大致可区分为生长发育与形态建成、物质与能量代谢、信息传递和信号转导三个方面。 随着人类对生命认知程度的提高，以及实验技术的迅速发展，生理学已从过去只针对生命个体、组织与器官的研究，深入到细胞与亚细胞以及分子层次上研究。把宏观与微观结合来阐明生命活动的规律是当前生理学的研究热点。并且，不同生命体之间生理特性的比较也成为今后生理学新的发展方向。该学科是一门基础性的学科，其发展不仅为生命科学的发展提供重要基础理论和技术支撑，而且与国家生物资源保护与可持续利用、生态环境建设、国民经济发展有着密切联系。

  该学科拥有良好的科研团队与教学师资力量，具有扫描电镜、细胞融合仪、荧光显微镜、酶标仪、紫外分光光度计、显微成像系统等，能完成各种生理实验。